Terbentuknya sebuah perpustakaan perguruan tinggi sangat berkaitan dengan berdirinya,PerguruanTinggi yang bersangkutan, begitu pula denganPerpustakaanUniversitas Pattimura (Unpatti) Ambon. Universitas Pattimuradidirikan pada saat beberapa tokoh masyarakat Maluku mengambil Prakarsa untuk mendirikan suatu Lembaga Pendidikan Tinggi di Maluku, yang dimulai oleh seorangtokoh Pendidikan yaituDr. J.B. Sitanala (almarhum). Beliau adalah seorang dokter, tokoh di Maluku yang berjasa dalam bidang kemasyarakatan pada umumnya dan bidang Pendidikan pada khususnya.
Untuk mewujudkan cita-cita yang luhur itu dibentuk suatu Yayasan PerguruanTinggi Maluku Irian Barat pada tanggal 20 Juli 1955 yang diketuai oleh Bapak Cornelis Loppies. Yayasan itu terus bekerja dan pada Tanggal 03 Oktobrt 1956, berhasil mendirikan Fakultas Hukum yang merupahkan Fakultas Pertama atau yang tertua dalam lingkup Universiras Pattimura.,
dan Untuk memenuhi kebutuhan pembelajaran dibangun Kerjasama antartokoh-tokoh masyarakat yakni dengan menyumbangkan koleksi-koleksi pribadi sehingga menjadi koleksi kecil, dan dalam berjalannya waktu koleksi bahan Pustaka mulai bertambah hinggah memungkinkan untuk membangun sebuah Perpustakaan.,
Pada tahun 1958 perpustakaan Universitas Pattimura diresmikan dengan koleksi bahan Pustaka masih Sebagian besar terdiri dari buku-buku hukum
Pada Tahun 1963 Universitas Pattimura dialihkan statusnya dari Universitas Swasta menjadi Universitas Negeri dengan Surat Keputusan Presiden RI No. 66 Tahun 1963. Dengan demikian secara otomatis Perpustakaan Universitas Pattimura resmi menjad iPerpustakaan Negeri. Dan sejak tahun itulah perpustakaan Universitas Pattimura mendapatkan bantuan bahan Pustaka dari berbagaik alangan, baik dari pemerintah dan Perguruan Tinggi lainnya baik dari dalam maupun luar negeri.
Orang pertama yang berjasa dalam mengelola Perpustakaan Universitas Pattimuradari Tahun 1958-1962 adalah Bapak Jan Nahumury (alm) seorang pegawai senior Universitas Pattimura.
Pada saat Perpustakaan Univeritas Pattimura berstatus sebagai Perpustakaan Negeri dengan kedudukan sebagai Perpustakaan Pusat, dan masing-masing Fakultas diberi kesempatan untuk membangun perpustakaan sendiri, dengan koleksi bahan Pustaka disesuaikan dengan bidang ilmu masing-masing yang diasuh.
Semenjak Perpustakaan universitas Pattimura menjadi Perpustakaan Negeri daritahun 1963 sampai sekarang, telah beberapa kali mengalami pergantian kepala, yang dapat dilihat pada periodisasi sebagai berikut :
NAMA-NAMA PIMPINAN UPT. PERPUSTAKAAN UNPATTI
DARI TAHUN 1963 SAMPAI SEKARANG
- Tahun 1963-1964 : M. Polnaya
- Tahun 1964-1969 : O. kastanya
- Tahun 1972-1973 : J. J. Wenno
- Tahun 1973-1979 : C.C. Seumahu
- Tahun 1979-1999 : Ali Zawawi, SH
- Tahun 1999-2002 : A. Souissa, S. Sos (PLH)
- Tahun 2002-2010 : Cristian Porsisa, S. Sos
- Tahun 2010-2020 : Leonora Picauly, S. Sos
- Tahun 2021 Sekarang : Irmawati K.A. Duil, S. Sos